Впервые в Казахстане кафедра урологии открылась на базе АГМИ в 1940г. Ее первым руководителем был В.В.Зикеев.  С 1955г по 1969г кафедру возглавлял проф. З.В.  Фанштейн. В период с 1969г по 1970г кафедрой урологии АГМИ руководил доц. Б.У. Джарбусынов. В 1971-1975гг кафедрой заведовал проф. Е.П. Еганов. С 1976г по 1996г кафедру урологии АГМИ вновь возглавил проф. Б.У. Джарбусынов. Под  непосредственным руководством Б.У. Джарбусынова 14 декабря 1990г  был открыт НИИ Урологии, он же и стал его первым директором. Б.У. Джарбусыновым подготовлено 15 кандидатов и 8 докторов наук. За свой вклад в развитие казахстанской урологии Б.У. Джарбусынов награжден орденом «Парасат» и званием заслуженный деятель науки РК. После смерти Б.У. Джарбусынова в период с 1997г по 2002г кафедру возглавлял проф. М.К. Алчинбаев. С 2003г по 2007г кафедрой заведовал доц. С.Г. Зазулевский. С 2008г по 2013 г кафедрой урологии с курсом нефрологии руководил проф. А.Т. Токсанбаев.

С 2013 года и по настоящее время урологией руководит проф. Алчинбаев М.К. Имеет награды: знак «Қазақстан Ресубликасы денсаулық сақтау iciнің үздігі», звание «Заслуженный работник Республики Казахстан» (1998 г.), награжден орденом «Құрмет» (2003 г.). Является Лауреатом Государственной премии Республики Казахстан 2005 года в области науки, техники и образования за работу «Модель реформирования и совершенствования системы оказания медицинской помощи на основе разработки и внедрения новых высокоэффективных технологий в рыночных условиях». К 70-летию образования  КазНМУ им. С.Д. Асфендиярова, как один из ведущих хирургов республики, был награжден памятным «Золотым скальпелем». Кафедра урологии с группой нефрологии под его руководством за всю историю Каз НМУ по всем показателям заняла 1 место (2002 г.). Избран действительным членом (академиком) Академии медико-технических наук РФ (2007 г.), награжден высшим наградным знаком  Академии — «Золотая медаль им. А. Чижевского». Награжден нагрудным знаком МО и Н РК «За заслуги в развитии науки Республики Казахстан» (2009 г.), нагрудным значком качества «Безупречно» (Алматы, 2009 г.). Лауреат почетной награды «Интеллект нации» (2010 г.) В 2011 году был награжден орденом «Парасат» и «Алтын Адам» — Человек года в номинации «Лучший научный деятель года, 2013 г. – член-корреспонденты НАН РК, 2013 году Выбор года в номинации «Врач года».

C сентября 2016 года кафедра, была переименована в курс урологии.

С сентября 2017года курс урологии, была переименова на кафедру урологии.